Лаборатория МРТ-технологии занимается разработкой и клиническим внедрением современных методов МРТ-диагностики, включая функциональную МРТ, трактографию и количественную оценку церебрального кровотока. Особое внимание уделяется инновационным подходам к исследованию процессов миелинизации, пренатальной диагностике нарушений развития мозга, а также комплексной оценке неврологических и сосудистых патологий.
Приоритетными направлениями являются ранняя диагностика нарушений развития у детей, изучение механизмов нейродегенерации, мониторинг восстановительных процессов после повреждений мозга и создание новых диагностических алгоритмов.
В составе Лаборатории МРТ-технологии выделены Группа магнитно-резонансной биофизики, а также Молодежная лаборатория функциональной нейровизуализации (с 2024 года).